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堀田 耕司

  • PI
慶應義塾大学理工学部生命情報学科
准教授
Research Areas
発生生物学, 進化発生生物学
Keywords
胚発生、軸回転、ホヤ、尾芽胚、左右非対称性

研究概要

細胞同士はどのように連携（情報伝達）し階層を超え個体として機能するに至るのか？といった問いに対し、脊索動物ホヤをモデル生物として用いた研究を行っています。ホヤは脊索動物のエッセンスを凝縮したようなシンプルで無駄のない生物です。このホヤの良さを最大限に引き出すことでこれまで解けなかった生物学のBIGクエスチョン（命題）に挑んでいます。本領域では脊索動物の進化的に保存された形を生み出すしくみをメカノバイオロジーの観点から理解したいと思います。他には、生物の透明性はどのようにして獲得されたのか？変態などの体を作り変えるしくみの解明や運動神経回路の発生機構解明、生物多様性プラットフォームの構築などにも取り組んでいます。

経歴

堀田耕司 北海道大学卒業後、京都大学大学院修士・博士課程修了（指導教官：佐藤矩行教授）。国立遺伝学研究所の五條堀孝教授のもとでポスドク研究を行った後、 2005年より慶應義塾大学理工学部生命情報学科・助教、専任講師を経て2019年より同大学准教授。

関連業績

  • Admp regulates tail bending by controlling ventral epidermal cell polarity via phosphorylated myosin localization
    Yuki S. Kogure, Hiromochi Muraoka, Wataru C. Koizumi, Raphael Gelin-alessi, Benoit Godard, Kotaro Oka, Carl-Philipp Heisenberg*, and Kohji Hotta*
    Development
    DOI: doi.org/10.1242/dev.200215
  • MiniSOG2-mediated Specific Photoablation of Motor Neurons in Ascidian Embryos.
    Madoka K. Utsumi, Taichi Akahoshi, Kotaro Oka, Hotta,K.＊
    bioprotocol,
    DOI: https://doi.org/10.21769/BioProtoc.4537
  • Developmental Table and Three-Dimensional Embryological Image Resource of the Ascidian Ascidiella aspersa
    Funakoshi HM, Shito TT, Oka K, Hotta, K.
    Front Cell Dev Biol.
    DOI: https://doi.org/10.3389/fcell.2021.789046
  • Bilaterally Asymmetric Helical Myofibrils in Ascidian Tadpole Larvae.
    Matsuo K, Tamura R, Hotta K, Okada M, Takeuchi A, Wu Y, Hashimoto K, Takano H, Momose A, Nishino A.
    Front Cell Dev Biol.
    DOI: https://doi.org/10.3389/fcell.2021.800455
  • A single motor neuron determines the rhythm of early motor behavior in Ciona.
    Akahoshi T, Utsumi MK, Oonuma K, Murakami M, Horie T, Kusakabe TG, Oka K, Hotta, K.
    Sci Adv.
    DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.abl6053
  • Spatiotemporal dynamics of single cell stiffness in the early developing ascidian chordate embryo.
    Authors: Y. Fujii, W. C. Koizumi, T. Imai, M. Yokobori, T. Matsuo, K. Oka, Hotta, K.＊, T. Okajima＊
    Commun. Biol.
    DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-021-01869-w
  • Two-Round Ca2+ transient in papillae by mechanical stimulation induces metamorphosis in the ascidian Ciona intestinalis type A.
    M. K. Wakai, M. J. Nakamura, S. Sawai, Hotta, K.＊, K. Oka
    Proc. R. Soc. B Biol. Sci.
    DOI: https://doi.org/10.1098/rspb.2020.3207
  • Phylogenetic comparison of egg transparency in ascidians by hyperspectral imaging.
    T. T. Shito, N. Hasegawa, K. Oka＊, Hotta, K.＊
    Scientific Reports.
    DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-020-77585-y
  • The ontology of the anatomy and development of the solitary ascidian Ciona: the swimming larva and its metamorphosis.
    Hotta, K.＊, Dauga, D., Manni, L＊
    Scientific Reports.
    DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-020-73544-9
  • Different strategies for tissue scaling in dwarf tailbud embryos revealed by single-cell analysis.
    Matsumura, K.D., Nakamura, M.J., Koizumi, W.C., Hotta, K.＊, Oka, K
    Dev Biol.
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2020.01.008