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奥田 覚

  • Co-PI
金沢大学 ナノ生命科学研究所
准教授
Research Areas
生体力学、生物物理学、計算力学、レオロジー、発生生物学
Keywords
自己組織化、幹細胞オルガノイド、多階層シミュレーション、3Dバーテックスモデル、AFM計測

研究概要

生命システムの自己組織的な構造形成の仕組み、特に多細胞の3次元ダイナミクスにおける力学過程は、生命らしさを感じる魅力的な研究課題です。私たちの研究室では、多細胞の3次元ダイナミクスを分子集団や1細胞の解像度でシミュレーションする新規の数理モデリング基盤を確立し、多能性幹細胞由来のオルガノイド培養、マイクロ操作による力学試験、物理学に基づく理論解析を統合した多面的な解析に取り組んでいます。このような異分野の技術を融合した新規のアプローチにより、多細胞ダイナミクスの包括的かつ定量的な予測と高精度な操作を実現することで、これまでにない新分野の開拓を目指しています。

経歴

2008年に京都大学工学部物理工学科卒業、2010年に同大学工学研究科機械工学専攻修士課程修了（北條正樹教授の研究室）、2013年に同研究科マイクロエンジニアリング専攻博士課程修了し学位を取得（安達泰治教授の研究室）。JSPS特別研究員（DC1）。2013年より、理研CDB研究員（笹井芳樹ディレクターと永樂元次チームリーダーの研究室）。2016年より同研究所基礎科学特別研究員と科学技術振興機構さきがけ研究者を兼任。2019年より金沢大学ナノ生命科学研究所准教授。

関連業績

  • Continuum modeling of non-conservative fluid membrane for simulating long-term cell dynamics
    Satoru Okuda, Katsuhiko Sato, Tetsuya Hiraiwa
    The European Physical Journal E
    DOI: https://doi.org/10.1140/epje/s10189-022-00223-0
  • Src activation in lipid rafts confers epithelial cells with invasive potential to escape from apical extrusion during cell competition
    Kentaro Kajiwara, Ping-Kuan Chen, Yuichi Abe, Satoru Okuda, Shunsuke Kon, Jun Adachi, Takeshi Tomonaga, Yasuyuki Fujita, Masato Okada
    Current Biology
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.cub.2022.06.038
  • Polarized interfacial tension induces collective migration of cells, as a cluster, in a 3D tissue
    Satoru Okuda, Katsuhiko Sato
    Biophysical Journal
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.04.018
  • A Mechanical Instability in Planar Epithelial Monolayers Leads to Cell Extrusion
    Satoru Okuda, Koichi Fujimoto
    Biophysical Journal
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2020.03.028
  • Marcksl1 modulates endothelial cell mechanoresponse to haemodynamic forces to control blood vessel shape and size
    Igor Kondrychyn, Douglas J. Kelly, Núria Taberner Carretero, Akane Nomori, Kagayaki Kato, Jeronica Chong, Hiroyuki Nakajima, Satoru Okuda, Naoki Mochizuki, Li-Kun Phng
    Nature Communications
    DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19308-5
  • Apical junctional fluctuations lead to cell flow while maintaining epithelial integrity
    Satoru Okuda, Erina Kuranaga, Katsuhiko Sato
    Biophysical Journal
    DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2019.01.039
  • Strain-triggered mechanical feedback in self-organizing optic cup morphogenesis
    Satoru Okuda, Nozomu Takata, Yuiko Hasegawa, Masako Kawada, Yasuhiro Inoue, Taiji Adachi, Yoshiki Sasai, Mototsugu Eiraku
    Science Advances
    DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.aau1354
  • Combining Turing and 3D vertex models reproduces autonomous multicellular morphogenesis with undulation, tubulation, and branching
    Satoru Okuda, Takashi Miura, Yasuhiro Inoue, Taiji, Adachi, Mototsugu Eiraku
    Scientific Reports
    DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-018-20678-6
  • Induced cortical tension restores functional cell junctions to adhesion-defective carcinoma cells
    Shoko Ito, Satoru Okuda, Masako Abe, Mari Fujimoto, Tetsuo Onuki, Tamako Nishimura, Masatoshi Takeichi
    Nature Communications
    DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-017-01945-y